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Laurea Magistrale

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Bioinformatica - 6 CFU - A.A. 2011/2012

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Insegnante

Prof. Giorgio Valle

Periodo

I anno - 2 trimestre | 16/01/2012 - 17/03/2012

Curriculum:

Ore: 40 Frontali, 8 Laboratorio, 0 Esercizi

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Programma del Corso

1) Introduzione alla Biochimica e Biologia Molecolare. Utilizzo di banche dati molecolari.
2) Allineamento di sequenze di acidi nucleici e proteine, matrici di sostituzione, metodi di allineamento esatto e euristici, fasta, blast, allineamento multiplo.
3) Evoluzione e filogenesi molecolare. Algoritmi UPGMA, Neighbour Joining e Maximum Parsimony.
4) Analisi strutturale delle proteine, banche dati di strutture proteiche, programmi di visualizzazione, ricerche di similarita’ strutturale.
5) Predizione di caratteristiche strutturali da sequenza, machine learning. Predizione di strutture 3D, homology modelling e fold recognition.
6) Ricerca di pattern e di motivi funzionali. Determinanti strutturali della funzione e classificazione funzionale. Cenni di Systems Biology.

Prerequisiti: Agoritmi e Strutture Dati

Propedeuticità:

Ausili Didattici: - -

Testi di Riferimento: Introduction to Bioinformatics. A.M. Lesk, Oxford University Press, 3rd edition, 2008.

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